Como houve a mudança de sexo de Arthur em Fate/Stay Night, mas em Fate/Prototype, Saber é um homem e Shirou é uma mulher (Ayaka Sajou), mas esse merece uma parte só para ele. Por motivos de público alvo, Nasu acabou trocando o sexo dos protagonistas. Voltando ao assunto, existem pessoas que acreditam que Arthur realmente existiu, alguns especialistas acreditam que ele foi baseado em algum herói da época que, com o passar do tempo, teve sua história marcada por magia e fantasia. Há duas histórias de como surgiu sua lenda.
Uther Pendragon estava sendo perseguido por seus inimigos, antes de morrer ele fincou sua Excalibur em uma pedra e jurou que o próximo homem que retirar sua espada se tornará o novo rei. Todos os grandes guerreiros tentaram retirar a espada da pedra, mas falharam. Com o tempo, isso acabou virando uma espécie de torneio onde o vencedor teria a chance de retirar a espada da pedra. Arthur era um jovem criado por Ector e tinha um irmão chamado Cai. Seu irmão estava participando do torneio, mas Arthur acabou perdeu a espada de Cai, desesperado, ele procura a espada mais próxima dele e acaba retirando a Excalibur da pedra. Ao fazer isso, todos os presentes curvaram-se para Arthur, menos Ban, que jurou guerra ao jovem. Após ter começado a guerra, Arthur consegue capturar Ban e o pede para jurar fidelidade ao novo rei, mas ele se recusa a jurar lealdade para alguém que não havia se tornado um cavaleiro de verdade, então Arthur diz "Estás certo meu senhor, faça-me então cavalheiro e jure fidelidade ao seu rei.". Ao ouvir isso, Ban pegou a Excalibur e nomeou Arthur como cavaleiro diante de todos.
A outra versão é que Igraine foi obrigada por Viviane (a Dama do Lago) a se deitar com Uther para que tivesse um filho. Mas Igraine era casada com Gorlois de Cornualha e por isso teve que esconder seu filho dando para Ector. Quando Uther morreu, Arthur foi levado para Avalon para ser coroado seguindo a tradição do Gamo-Rei, ele teve que deitar com a Deusa incorporada no corpo de sua própria irmã e após isso ele recebeu a espada sagrada Excalibur e sua bainha coberta com magia das sacerdotisas de Avalon. A bainha servia para proteger contra ferimentos e desmaios. E assim, Arthur conseguiu que os povos antigos do reino fossem seu aliado para sempre, e não negando sua parte católica, conseguindo dois grande aliados para reinar sobre a Grã-Bretanha. Há um livro chamado "As brumas de Avalon" onde é contado a história de Arthur na visão das mulheres, o nascimento de Arthur e seus momentos de glória já foram previsto pela Viviane e Merlin que fazem de tudo para que Igraine tenha o filho, também conta a preparação de Morgana, irmã de Arthur, para se tornar a sacerdotisa e sucessora de Viviane, a história segue até a morte de Arthur. É uma ótima leitura.
A versão da Type-Moon é que Uther Pendragon não podia aceitar que Arthur fosse mulher, por isso Merlin tem a ideia que Ector cuidasse de Arthuria. Quando ela completa 15 anos, Uther morre sem deixar herdeiros e a Grã-Bretanha entra em crise após a grande ameaça dos Saxões, Merlin não vê outra alternativa e conta a verdade para Arthuria e diz que o povo do reino irá reconhecer ela como o nova sucessora se conseguir puxar a Caliburn da pedra na seleção do rei, ao retirar a Caliburn, ela receberia o dever de aceitar as dificuldades de um líder e ser responsável pelo bem-estar de seu povo. Mesmo sendo mulher, Arthuria retirou a espada e liderou a Grã-Bretanha e assim, ela levou seu reino à vitória graças a sua fortaleza em Camelot, junto com Merlin e os Cavaleiros da Távola Redonda, ela levou paz e prosperidade ao povo. Ao ter Caliburn destruída, Athuria recebe de Viviane a Excalibur junto com Avalon, a bainha sagrada que protegeria o rei de envelhecer e de se ferir em batalha. Mas por sempre servir ao povo, Arthuria sentia mal por ter que sacrificar suas emoções em nome de seu reino, muitos súditos viam ela como uma pessoa sem coração e, para piorar, ela perde sua bainha enquanto defendia o reino de ataques externos, quando volta, Arthuria descobre que na Grã-Bretanha estão começando as guerra civis.
A morte de Arthur acontece na famosa Batalha de Camlann onde ele luta contra Mordred (alguns dizem ser o sobrinho ou filho de Arthur, no anime ele foi tratado como filho), ele consegue matá-lo, mas é gravemente ferido. Bedviere encontra Arthuria caída e a leva até a Ilha Sagrada, chegando lá, ela pede que Bedviere retorne a espada sagrada para Viviane, com isso ele refletiria todos seus erros e arrependimentos. No seu leito de morte, Arthuria pede para o Mundo(Arayashiki), em troca de ser um Espírito Heroico, alguém para substituí-la e levar seu reino à paz e prosperidade eterna.
Na quarta guerra pelo Cálice Sagrado, Arthuria é invocada por Emiya Kiritsugu sob a classe Saber usando a Avalon como catalizador. Após o término da guerra, Emiya encontra um garoto no meio da destruição, para mantê-lo vivo ele usa a Avalon e implanta no corpo deste garoto. 10 anos depois, Emiya Shirou invoca Arthuria para lutar novamente pelo Cálice Sagrado. A única rota que a Saber fica viva é em um dos finais de Unlimited Blade Works como servo da Tohsaka, em Heaven's Feel, ela é sugada pelas forças de Angra Mainyu e se torna servo de Matou Sakura como Saber Alter.